La protección de las áreas de recarga hídrica es una medida prioritaria de la GIRH en la cuenca alta del río Coco. Dada la particular importancia de esta medida y su dimensión, es tratada como línea de acción propia. INAFOR y MARENA son los principales socios institucionales.
La Asociación de Profesionales para el Desarrollo Integral del Nicaragua (APRODEIN) es el socio operativo que ejecuta las actividades de campo.